La inquisición ejecutó a una sola persona indígena en América: Carlos Ometochtzin
Aunque el mito popular suele vincular la Inquisición española directamente con la devastación masiva de las poblaciones indígenas, el Tribunal del Santo Oficio (osea, la Inquisicón) tenía expresamente prohibido procesar a los pueblos indígenas. Debido a que los nativos americanos eran considerados nuevos conversos al catolicismo, estaban oficialmente exentos de los tribunales formales de la Inquisición.
La Inquisición española formal se dirigió principalmente a los cristianos bautizados, en particular a los «conversos» (judíos conversos sospechosos de practicar el judaísmo en secreto) y a los europeos acusados de herejía. Los historiadores estiman que, a lo largo de los 350 años de historia de la Inquisición española en América, solo entre 50 y 60 personas de todos los orígenes combinados fueron ejecutadas (principalmente quemadas en la hoguera). El Santo Oficio ejecutó a una sola persona indígena en América. Un prominente hombre indígena, históricamente conocido por su nombre cristiano Carlos Ometochtzin, fue quemado en la hoguera en la Ciudad de México en 1539 por supuestamente recaer en prácticas religiosas indígenas. Este acto fue duramente reprochado y castigado por el propio rey de España y las autoridades eclesiásticas de la metrópoli, argumentando que no era legal ni cristiano aplicar castigos tan severos a indígenas en proceso de evangelización. El obispo Zumárraga fue reprendido y perdió su cargo.
Posteriormente, la Corona española aclaró que los pueblos indígenas estaban exentos, poniendo fin a las ejecuciones oficiales de la Inquisición contra los nativos americanos.
La verdadera causa de la despoblación masiva de las Américas no fue la Inquisición, sino la «Gran Mortandad». Los historiadores estiman que entre el 80% y el 95% de la población indígena murió durante los primeros 100 a 150 años de contacto con los europeos. Este catastrófico colapso demográfico (que sumó millones de muertes) fue impulsado principalmente por enfermedades euroasiáticas importadas, como la viruela y el sarampión.
Texto generado por la IA de google a la pregunta: «Cuantos indios hispano amerianos murieron quemados por la Inquision«

Al igual que pasó con la expulsión de los Judios, a la inquisision española se le han atribuido miles de muertes que nunca existieron, fundamentalmente a raiz de la difusión masiva de la Brevisima de de las Casas. El libro fue profusamente ilustrado con imagenes falsas de torturas que nunca existieron pero que la leyenda negra se ha encargado de propagar como si hubisen sido verdad. En el dibujo que ilustra este texto se sugiere que los Indios del Nuevo Mundo eran quemados de forma masiva igual que lo hacia la Inquisión centro europea, nunca la Española y menos en las Indias. Es curioso, pero de las Casas nunca habló de los cientos de atrocidades que se hacían en su territorio (la Nueva España) donde si se quemaba a la gente en la celegraciones correspondientes al 12º mes llamado Teotleco en honor a Tezcatlipoca donde se practicaban Sacrificios (en todas la celebraciones siempre habia muertos) por fuego y extracción del corazón (fuente: Iturrieta)
En el libro » Witch Trials by Peter T. Leeson and Jacob W. Russ» y cuyo resumen se inlustra en el gráfico que sigue, se muestra como en 500 años en españa se condeno a 1 persona, a pesar de que la Inquisición realizó casi 2000 jucios. Tal vez por eso entre los historiadores sin sesgo negrolegendario, existe el consenso de que la Inquisicion (Santo Oficio) era un tribunal muy garantista y preferido por los reos. Es curioso como diciendo miles de veces la misma mentira, se puede dar la vuelta a la realidad.